Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Best2Q8BGM5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms