Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja6Q6S5G4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja6Q6S5G4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms