Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nop58Q6DFW4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nop58Q6DFW4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms