Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GKAP1Q5VSY0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms