Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc43Q3V0L5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms