Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc102aQ3TMW1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms