Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c3Q3TMP1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms