Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lingo4Q149C3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lingo4Q149C3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms