Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cab39Q06138 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms