Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc4P51655 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc4P51655 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms