Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RoraP51448 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RoraP51448 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RoraP51448 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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