Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms