Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf9P41274 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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