Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hsf1P38532 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hsf1P38532 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms