Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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