Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChgaP26339 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms