Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JunP05627 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JunP05627 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JunP05627 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JunP05627 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
JunP05627 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms