Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01656 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01656 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01656 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01656 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms