Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01654 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01654 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01654 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01654 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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