Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlkO54988 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SlkO54988 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlkO54988 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms