Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcshO08795 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcshO08795 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcshO08795 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcshO08795 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrkcshO08795 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms