Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo5cE9Q1F5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms