Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FgaE9PV24 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FgaE9PV24 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgaE9PV24 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgaE9PV24 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms