Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AU015836B2RUM3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AU015836B2RUM3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms