Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lemd3Q9WU40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd3Q9WU40 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms