Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPG2Q9UBF2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms