Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VapbQ9QY76 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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VapbQ9QY76 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VapbQ9QY76 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VapbQ9QY76 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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