Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LitafQ9JLJ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LitafQ9JLJ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms