Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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