Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlnrd1Q9ERE8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlnrd1Q9ERE8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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