Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SyncQ9EPM5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms