Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf4Q9DAW6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms