Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TrmuQ9DAT5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TrmuQ9DAT5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TrmuQ9DAT5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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