Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms