Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms