Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx47Q9CWX9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx47Q9CWX9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx47Q9CWX9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx47Q9CWX9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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