Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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