Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTKNQ9BST9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms