Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms