Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP9Q99956 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms