Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC4Q8WW27 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms