Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmcd1Q8VEE1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmcd1Q8VEE1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms