Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stx18Q8VDS8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms