Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a7Q8BGY9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Slc5a7Q8BGY9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Slc5a7Q8BGY9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Slc5a7Q8BGY9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a7Q8BGY9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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