Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg2bQ80XK6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg2bQ80XK6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg2bQ80XK6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg2bQ80XK6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg2bQ80XK6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg2bQ80XK6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms