Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp34Q6ZQ93 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp34Q6ZQ93 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms