Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt42Q6IFX2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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