Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phox2aQ62066 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phox2aQ62066 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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