Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hace1Q3U0D9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms