Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms